男科的治疗包括两个方面，一是去除疣体，二是防止复发。目前尚无任何一种方法可以彻底根除HPV，临床上大多采用综合治疗。由于存在个体差异，有时也采用个性化的治疗方案。通过去除疣体，提高患者全身和局部的免疫力，减少或预防本病的复发，以达到彻底治疗的目的。同时，应对其性伴进行检查和治疗。

　　目前男科的治疗方法很多，主要有化学治疗、化学腐蚀性药物治疗、物理治疗、免疫治疗等，其治疗效果很好，但对复发的防治效果还不是太理想。

　　艾拉－光动力疗法（ALA－PDT），是利用5－氨基酮戊酸（5－aminolevulinicacid5－ALA）作为光敏剂，进行光动力反应治疗皮肤病的一种新方法，它通过高度选择性地作用于靶细胞而达到治疗的目的，并具有使用简单、疗效可靠、不良反应少、可多次重复治疗等优点。特别对宫颈、尿道口、肛管内等特殊部位难治性男科的治疗效果较好，增加了其治愈率，降低了复发率。